بررسی اثرات منفی نوترکیبی بر صحت برآورد ارزش های اصلاحی ژنومی
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه مازندران
- نویسنده فرهاد اکبرپورتجریشی
- استاد راهنما هادی سیاح زاده مهدی ساعتچی
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1388
چکیده
در این تحقیق، ژنومی متشکل از 1 کروموزوم به طول 100 سانتی مورگان به کمک نرم افزار visual basic شبیه سازی شد. جهت بررسی تاثیر افزایش تراکم نشانگری بر کاهش صحت برآورد ارزش های اصلاحی ژنومی، از تعداد متفاوت نشانگر با تراکم مختلف (100 نشانگر با فواصل یکسان 1 سانتی مورگان، 200 نشانگر با فواصل یکسان 5/0 سانتی مورگان و 1000 نشانگر با فواصل یکسان 1/0 سانتی مورگان) شبیه سازی شد. 10 مکان صفت کمّی یا qtl که به طور تصادفی بر روی کروموزوم پراکنده شده بودند، شبیه سازی شد. جمعیتی با اندازه موثر 100 فرد (50 نر و 50 ماده) شبیه سازی شد. این ساختار جمعیتی برای 50 نسل با آمیزش تصادفی ادامه یافت تا عدم تعادل پیوستگی مورد نظر بین نشانگرها و qtl ها بوجود آید. بعد از 50 نسل آمیزش تصادفی، اندازه جمعیت به تعداد 500 فرد (250 نر و 250 ماده) در نسل 51 گسترش یافت. این اندازه جمعیت برای 12 نسل بعدی (تا نسل 63) ثابت ماند. دو صفت با وراثت پذیری 5/0 و 1/0 در نظر گرفته شد. نتایج این تحقیق نشان داد که عواملی نظیر تعداد نشانگرها، تراکم نشانگرها و وراثت پذیری صفت بر صحت برآورد ارزش های اصلاحی ژنومی موثر هستند. نتایج نشان داد که هرچه تعداد نشانگرها کمتر، تراکم آنها بیشتر و میزان وراثت پذیری صفت بیشتر باشد، صحت برآورد ارزش های اصلاحی ژنومی نیز بیشتر است. افزایش تراکم نشانگری با افزایش تعداد نشانگرها همراه است. نتایج نشان داد که تاثیر تراکم نشانگری از تاثیر تعداد نشانگرها بیشتر است، بطوریکه افزایش تراکم نشانگرها به همراه افزایش تعداد نشانگرها سبب افزایش صحت برآورد ارزش های ژنومی می شود. همچنین نتایج نشان دادند که افزایش تراکم نشانگری تا حد زیادی اثرات منفی نوترکیبی را با گذشت نسل ها از زمان برآورد اثرات نشانگری کاهش داده و در نتیجه سرعت کاهش صحت برآورد ها را کم می نماید. با توجه به این نتایج می توان پیشنهاد نمود که از افزایش تراکم نشانگرها می توان جهت تعدیل اثرات منفی نوترکیبی بر صحت برآورد ارزش های اصلاحی ژنومی استفاده نمود.
منابع مشابه
تاثیر وراثت پذیری و تعداد جایگاه صفات کمی بر میزان صحت برآورد ارزش اصلاحی ژنومی
در مقایسه با روش های اصلاح سنتی، استفاده از اطلاعات ژنومی باعث افزایش قابل ملاحظه ای در پاسخ به انتخاب برای حیوانات جوان فاقد رکورد فنوتیپی می شود. انتخاب ژنومیک بر انتخاب بر پایه ارزش اصلاحی برآورد شده ژنومی استوار است. هدف پژوهش حاضر بررسی تاثیر وراثت پذیری صفت و تعداد جایگاه صفات کمی بر صحت برآورد ارزش های اصلاحی ژنومی بوده است. به این منظور طراحی ژنوم و جمعیت مورد نیاز از طریق شبیه سازی رای...
متن کاملتاثیر افزایش تراکم نشانگرها بر صحت پیش بینی ارزش های اصلاحی ژنومی
در این مطالعه، ژنومی متشکل از 3 کروموزوم هریک به طول 100 سانتی مورگان شبیه سازی شد. تعداد متفاوت نشانگر روی هر کروموزم با تراکم مختلف (100 نشانگر با فواصل 1 سانتی مورگان، 200 نشانگر با فواصل 0/5 سانتی مورگان، 1000 نشانگر با فواصل 0/1 سانتی مورگان و 2000 نشانگر با فواصل 0/05) در نظر گرفته شد. 30 مکان صفت کمی یا QTL که به طور تصادفی روی کروموزوم پراکنده شده بودند، شبیه سازی شدند. جمعیتی ب...
متن کاملمقایسه صحت برآورد ارزش های اصلاحی ژنومی و رایج با استفاده از تجزیه دوصفتی و تک صفتی
به منظور مقایسه صحت برآورد تجزیه های تک صفتی و چندصفتی ژنومی و رایج تعداد 100 حیوان غیرخویشاوند برای50 نسل، جهت ایجاد عدم تعادل پیوستگی بین جایگاه ها آمیزش تصادفی داشتند. برای هر حیوان ژنومی با طول 10مورگان و تعداد 10 کروموزوم با طول یکسان 1 مورگان، شبیه سازی شد. نشانگرهای SNP در فواصل مساوی بر روی هر کروموزوم قرار گرفتند و QTLها بصورت تصادفی روی ژنوم پخش شدند. تجزیه های تک صفتی و چند صفتی برای...
متن کاملتاثیر وراثت پذیری و تعداد جایگاه صفات کمی بر میزان صحت برآورد ارزش اصلاحی ژنومی
در مقایسه با روش های اصلاح سنتی، استفاده از اطلاعات ژنومی باعث افزایش قابل ملاحظه ای در پاسخ به انتخاب برای حیوانات جوان فاقد رکورد فنوتیپی می شود. انتخاب ژنومیک بر انتخاب بر پایه ارزش اصلاحی برآورد شده ژنومی استوار است. هدف پژوهش حاضر بررسی تاثیر وراثت پذیری صفت و تعداد جایگاه صفات کمی بر صحت برآورد ارزش های اصلاحی ژنومی بوده است. به این منظور طراحی ژنوم و جمعیت مورد نیاز از طریق شبیه سازی رای...
متن کاملبرآورد صحت ارزش های اصلاحی صفات پیچیده در جمعیت‌های بدون شجره با استفاده از نشانگرهای متراکم
هدف از این پژوهش برآورد صحت ارزشهای اصلاحی ژنگانی با استفاده از مدلGBLUP (Genomic Best Linear Unbiased Prediction) و مقایسۀ آن با روش سنتی با (BLUP) و بدون شجره (BLUP_noPed) به وسیله همانندسازی رایانهای بود. در این تحقیق، ژنگانی با سی جفت کروموزوم به‌گونه‌ای همانندسازی شد که شمار QTLها 3000 و شمار نشانگرها (SNP) 45000 جایگاه در نظر گرفته شدند. همچنین پیش‌فرضهای مختلف شامل دو جمعیت مؤثر 100 ...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه مازندران
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023